Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAVP06756 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms