Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNA4P05014 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms