Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP4K4O95819 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms