Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNUPNO95149 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNUPNO95149 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNUPNO95149 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNUPNO95149 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms