Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCN2BO60939 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms