Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS1O15524 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms