Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARPC5O15511 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC5O15511 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms