Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VGFO15240 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VGFO15240 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VGFO15240 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VGFO15240 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VGFO15240 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
VGFO15240 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VGFO15240 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VGFO15240 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VGFO15240 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VGFO15240 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VGFO15240 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms