Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms