Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
BHMG1C9JSJ3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHMG1C9JSJ3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHMG1C9JSJ3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHMG1C9JSJ3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BHMG1C9JSJ3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BHMG1C9JSJ3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHMG1C9JSJ3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms