Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM149AA5PLN7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms