Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FARSAQ9Y285 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FARSAQ9Y285 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms