Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVW-1Q9UQF0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms