Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HHLA2Q9UM44 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HHLA2Q9UM44 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms