Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RARRES3Q9UL19 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231 ms