Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DSEQ9UL01 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSEQ9UL01 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms