Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO3Q9UK99 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms