Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXD3Q9UJU5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms