Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPARGC1AQ9UBK2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGC1AQ9UBK2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms