Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HCN3Q9P1Z3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HCN3Q9P1Z3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms