Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRD1Q9P1U0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms