Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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