Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNK4Q9NYG8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNK4Q9NYG8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms