Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms