Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATAD3AQ9NVI7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATAD3AQ9NVI7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms