Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms