Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPRTNQ9H040 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms