Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNTNAP4Q9C0A0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms