Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRCC1Q9C099 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms