Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP1Q9C000 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP1Q9C000 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms