Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM54Q9BYV2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms