Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KATNB1Q9BVA0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms