Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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GINS3Q9BRX5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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