Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms