Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USB1Q9BQ65 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms