Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3GL3Q99963 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms