Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms