Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM227BQ96M60 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms