Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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