Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PGBD1Q96JS3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGBD1Q96JS3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms