Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIC2Q96JB3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIC2Q96JB3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms