Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms