Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCTD12Q96CX2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms