Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF4Q8WXU2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms