Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms