Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf43Q8TAL5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf43Q8TAL5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms