Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms