Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms