Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RTL3Q8N8U3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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