Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYCP3Q8IZU3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYCP3Q8IZU3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms